Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTFRP26992 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTFRP26992 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms