Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IL3RAP26951 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IL3RAP26951 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms