Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD27P26842 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD27P26842 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD27P26842 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD27P26842 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD27P26842 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD27P26842 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD27P26842 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD27P26842 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD27P26842 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD27P26842 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD27P26842 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD27P26842 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD27P26842 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms