Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMGB2P26583 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms