Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA3P26006 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms