Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKACBP22694 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKACBP22694 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms