Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC3P19447 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC3P19447 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC3P19447 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms