Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS1P17812 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTPS1P17812 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms