Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKMT2P17540 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CKMT2P17540 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKMT2P17540 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CKMT2P17540 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CKMT2P17540 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CKMT2P17540 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKMT2P17540 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CKMT2P17540 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKMT2P17540 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms