Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB9P17482 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB9P17482 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms