Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXB3P14651 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB3P14651 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB3P14651 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms