Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCANP13611 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCANP13611 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCANP13611 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCANP13611 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCANP13611 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCANP13611 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCANP13611 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCANP13611 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCANP13611 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCANP13611 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCANP13611 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCANP13611 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCANP13611 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCANP13611 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms