Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARBP10826 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARBP10826 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARBP10826 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARBP10826 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RARBP10826 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RARBP10826 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARBP10826 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RARBP10826 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARBP10826 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RARBP10826 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RARBP10826 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RARBP10826 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RARBP10826 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RARBP10826 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms