Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GLI4P10075 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GLI4P10075 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GLI4P10075 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GLI4P10075 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GLI4P10075 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GLI4P10075 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GLI4P10075 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GLI4P10075 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GLI4P10075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GLI4P10075 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms