Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM17P0DL12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM17P0DL12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms