Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAA1P0DJI8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAA1P0DJI8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms