Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM13P0DJ93 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM13P0DJ93 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM13P0DJ93 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms