Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC175P0C221 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC175P0C221 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms