Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPM1P09493 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPM1P09493 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM1P09493 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM1P09493 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM1P09493 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM1P09493 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM1P09493 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM1P09493 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM1P09493 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM1P09493 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM1P09493 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM1P09493 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM1P09493 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM1P09493 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms