Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB1P08034 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB1P08034 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB1P08034 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB1P08034 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms