Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM2P07951 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM2P07951 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM2P07951 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM2P07951 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM2P07951 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM2P07951 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM2P07951 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM2P07951 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPM2P07951 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms