Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLK3P07288 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLK3P07288 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLK3P07288 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLK3P07288 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLK3P07288 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms