Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEFMP07197 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEFMP07197 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEFMP07197 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEFMP07197 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEFMP07197 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEFMP07197 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms