Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPP00450 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPP00450 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPP00450 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPP00450 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPP00450 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPP00450 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPP00450 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPP00450 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPP00450 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPP00450 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms