Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC2O95714 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC2O95714 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC2O95714 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms