Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP4O95707 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP4O95707 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP4O95707 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP4O95707 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP4O95707 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP4O95707 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP4O95707 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POP4O95707 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POP4O95707 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POP4O95707 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP4O95707 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms