Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D2O95562 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D2O95562 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms