Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOBTB3O94955 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOBTB3O94955 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms