Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARP2O94887 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP2O94887 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP2O94887 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP2O94887 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP2O94887 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FARP2O94887 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP2O94887 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARP2O94887 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARP2O94887 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARP2O94887 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARP2O94887 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARP2O94887 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FARP2O94887 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FARP2O94887 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARP2O94887 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FARP2O94887 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms