Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM2O94769 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM2O94769 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ECM2O94769 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECM2O94769 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECM2O94769 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ECM2O94769 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECM2O94769 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM2O94769 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM2O94769 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM2O94769 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM2O94769 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECM2O94769 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms