Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG13O75143 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG13O75143 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG13O75143 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG13O75143 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG13O75143 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG13O75143 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG13O75143 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG13O75143 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG13O75143 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG13O75143 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG13O75143 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG13O75143 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms