Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSCO60682 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSCO60682 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MSCO60682 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSCO60682 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSCO60682 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSCO60682 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSCO60682 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSCO60682 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSCO60682 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSCO60682 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSCO60682 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms