Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP8B3O60423 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP8B3O60423 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms