Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP104O60308 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP104O60308 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP104O60308 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP104O60308 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP104O60308 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP104O60308 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP104O60308 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEP104O60308 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEP104O60308 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEP104O60308 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEP104O60308 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEP104O60308 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms