Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP8B1O43520 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms