Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COCHO43405 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COCHO43405 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COCHO43405 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COCHO43405 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COCHO43405 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COCHO43405 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COCHO43405 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COCHO43405 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COCHO43405 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms