Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN3O15551 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN3O15551 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms