Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD28O15084 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD28O15084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms