Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CASKO14936 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASKO14936 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASKO14936 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASKO14936 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASKO14936 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASKO14936 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASKO14936 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASKO14936 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASKO14936 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASKO14936 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASKO14936 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms