Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFIT3O14879 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFIT3O14879 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms