Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLR3AO14802 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR3AO14802 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms