Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD8O14715 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RGPD8O14715 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RGPD8O14715 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms