Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2F3O00716 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2F3O00716 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F3O00716 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F3O00716 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F3O00716 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F3O00716 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F3O00716 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms