Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 220.84■□□□□ 0.939e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 520.58■□□□□ 0.899e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.879e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 220.18■□□□□ 0.829e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.89e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.759e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 519.68■□□□□ 0.749e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.719e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-220ENST00000610946 529 ntTSL 518.96■□□□□ 0.639e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.69e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-205ENST00000520623 1923 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.529e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 417.96■□□□□ 0.479e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.459e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 417.3■□□□□ 0.369e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-203ENST00000518328 574 ntTSL 417.3■□□□□ 0.369e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.39e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.269e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-208ENST00000521684 935 ntTSL 315.42■□□□□ 0.069e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EPHX2-206ENST00000520666 582 ntTSL 410.86□□□□□ -0.679e-24■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.68e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 523■■□□□ 1.278e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-202ENST00000535560 670 ntTSL 519.27■□□□□ 0.688e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 517.16■□□□□ 0.348e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 517.12■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.871e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.871e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.455e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 MRPL9-205ENST00000467306 1264 ntTSL 223.11■■□□□ 1.291e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-217ENST00000541898 1198 ntTSL 221.21■□□□□ 0.995e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.955e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.955e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-209ENST00000536098 563 ntTSL 520.5■□□□□ 0.875e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-210ENST00000537263 1318 ntTSL 318.57■□□□□ 0.565e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.327e-28■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EAF1-202ENST00000449565 1037 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.295e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-218ENST00000543877 537 ntTSL 416.65■□□□□ 0.265e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.229e-43■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-214ENST00000540707 557 ntTSL 416.26■□□□□ 0.195e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 CHCHD5-204ENST00000469030 529 ntTSL 316.24■□□□□ 0.191e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 CHCHD5-205ENST00000489052 554 ntTSL 316.24■□□□□ 0.191e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.119e-43■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 MRPL9-204ENST00000462783 693 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.041e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 CHCHD5-203ENST00000454841 748 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-215ENST00000540792 951 ntTSL 215.01□□□□□ -0.015e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.067e-28■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.149e-43■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-216ENST00000541725 560 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.253e-11■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 ARMC6-212ENST00000539985 1252 ntTSL 212.59□□□□□ -0.395e-10■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 FAM189A1-204ENST00000560082 533 ntTSL 412.46□□□□□ -0.417e-28■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 CHCHD5-201ENST00000324913 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.631e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 MRPL9-207ENST00000478926 581 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 CHCHD5-202ENST00000409719 3272 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-14■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 STMN1-207ENST00000465604 2947 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.779e-43■■■■■ 38.5
DDX3XO00571 GLT8D1-215ENST00000497953 789 ntTSL 323.61■■□□□ 1.379e-13■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-19■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-19■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-19■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-216ENST00000523152 692 ntTSL 520.08■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-207ENST00000519776 677 ntTSL 215.08■□□□□ 05e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-208ENST00000520321 629 ntTSL 59.48□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-213ENST00000522310 667 ntTSL 29.48□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-219ENST00000523888 591 ntTSL 38.45□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-212ENST00000522280 684 ntTSL 27.94□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-217ENST00000523214 1134 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-205ENST00000519232 604 ntTSL 57.15□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-214ENST00000522810 990 ntTSL 37.15□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-209ENST00000520938 690 ntTSL 36.5□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-215ENST00000522927 782 ntTSL 36.28□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.575e-8■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.588e-9■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.494e-7■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 B4GALT7-202ENST00000502420 1305 ntTSL 519.27■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 B4GALT7-207ENST00000510761 552 ntTSL 315.21■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 B4GALT7-204ENST00000505433 1064 ntTSL 514.19□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.831e-31■■■■■ 38.4
DDX3XO00571 TUT1-201ENST00000278279 533 ntTSL 417.67■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.069e-15■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 TUT1-207ENST00000494385 699 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 TUT1-206ENST00000478537 643 ntTSL 515.08■□□□□ 03e-7■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 TUT1-205ENST00000476907 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 LRRC8A-202ENST00000372599 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-8■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-31■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-31■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 38.3
DDX3XO00571 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 38.3
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