Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN5O00501 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN5O00501 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms