Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BIN1O00499 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BIN1O00499 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BIN1O00499 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BIN1O00499 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BIN1O00499 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms