Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARVCFO00192 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARVCFO00192 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms