Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCER2I3L3R5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCER2I3L3R5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms