Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms