Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQV1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQV1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQV1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQV1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQV1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQV1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQV1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQV1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQV1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQV1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQV1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQV1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms